来自哥伦比亚大学和哈佛大学的研究团队尝试从大肠杆菌基因组中移除氨基酸异亮氨酸,以探索简化遗传密码的可能性。研究人员借助多种AI蛋白质设计工具,成功重新设计了核糖体小亚基中的21个蛋白质,使其不含异亮氨酸。最终工程菌株的生长速率约为正常菌株的60%,且经400代培养后未见异亮氨酸回复突变,验证了AI工具在蛋白质重设计领域的巨大潜力。
在里斯本举行的BIO-Europe Spring会议上,DenovAI Biotech创始人兼CEO Kashif Sadiq接受了pharmaphorum播客采访。该公司相信人类正处于蛋白质设计革命的风口浪尖,这将彻底改变人类健康和周围世界。Sadiq讨论了公司从AION Labs的起步发展,该联盟汇集了阿斯利康、默克、辉瑞、梯瓦等知名企业。他还探讨了如何利用人工智能和计算分子生物物理学的力量,开发能够从零开始设计蛋白质的基础技术平台。
MIT工程师开发出名为VibeGen的AI模型,能够根据蛋白质的运动模式而非仅仅形状来设计蛋白质。该系统通过指定目标振动和弯曲模式,反向生成相应的蛋白质序列。VibeGen采用两个协作AI代理,一个负责设计候选序列,另一个评估其运动性能。这项技术在医药、材料科学等领域具有广阔应用前景,可设计出更精确的治疗蛋白质和具有特定机械性能的生物材料。
这篇文章介绍了利用人工智能设计新酶的成功案例,这种酶有潜力分解塑料。尽管生物学告诉我们,简单的化学反应可能非常复杂,但通过AI驱动的蛋白质设计,研究人员能够创造出与自然界不同的酶。研究表明,设计酶的过程虽然复杂,但可以在计算机上完成,未来可能会有更多的应用。